DNA-informatica
De DNA amateur
Het is heel leuk, en gemakkelijk, om in DNA-banken (databases) te speuren naar informatie. Op dit ogenblik worden er ongelooflijke aantallen DNA volgordes afgelezen. De onderzoekers komen er niet aan toe om al deze informatie goed en grondig door te spitten. Er is slechts tijd om de eerste, de makkelijkste, vragen te beantwoorden; de vragen gekoppeld aan het onderzoek waar men de DNA volgordes voor heeft afgelezen. DNA amateur worden?
DNA volgordes vergelijken
De meest simpele vraag die je kunt onderzoeken is "waar komt deze DNA volgorde vandaan?". Dat gaat heel gemakkelijk. Je pakt een programma dat DNA volgordes kan vergelijken met alles wat er al in de DNA bibliotheken (DNA databanken) aanwezig is. Afhankelijk van wat je precies wilt zijn daarvoor vele programmas beschikbaar. De simpelste start is het programma "Blast" (Basic Local Alignment Search Tool). Je pakt een DNA volgorde, voert die in op de zoekpagina, drukt op "run Blast". Na 'n minuutje staat het resultaat op je scherm. Als je op de Blast pagina bent kun je zien (onderaan) dat er vele instellingen mogelijk zijn die bepalen hoe er precies wordt gezocht. Dat is voor de gevorderde gebruiker, voor later. Begin gewoon met de standaardinstellingen, dat gaat prima. Wil je weten wat je doet, lees de LeveDNA! Blast uitleg.
BLATTERY
Voor de beginner, om 't nog gemakkelijker te maken, heeft LeveDNA! een programma gemaakt, de BLATTERY. Hier staan altijd wat DNA volgordes voor je klaar, met daaraan gekoppeld één of meer vragen. Op dit moment staan er de DNA volgordes van ons Shaking Science project. en de DNA volgorde van de eerste vrouw ter wereld waarvan het DNA werd afgelezen, LeveDNA! ambassadeur Marjolein Kriek. Wil jij aan de slag met deze stukjes DNA, probeer de LeveDNA! BLATTERY maar eens 'n keer! Lukt het jou ook?, welke bacterie of welk stukje van Marjoleins DNA kreeg jij?